Guido Fanconi est un pédiatre et universitaire suisse.

Il sort diplômé de l'Université de Zurich en 1918. Après avoir travaillé à Lausanne, Munich et Berne, il est nommé directeur de l'Hôpital des Enfants et titulaire de la chaire de pédiatrie de l'Université de Zurich en 1929.

Ses travaux les plus notables portent sur la déshydratation, les équilibres hydro-électrolytiques, le rachitisme, le métabolisme du calcium ou encore la pneumonie. Il décrit pour la première fois en 1936 la pathologie aujourd'hui appelée mucoviscidose. Il laisse son nom à plusieurs maladies, dont l'anémie de Fanconi.

Il est élu correspondant étranger de l'Académie de médecine pour la division de médecine le 31 mai 1966. Il est élu associé étranger le 3 avril 1973.