Abondante bibliographie (cf. Catalogue général de la BnF) publiée sous le pseudonyme de Michel Brenet, dont : Histoire de la symphonie à orchestre : depuis ses origines jusqu'à Beethoven inclusivement, Paris : Gauthier-Villars, 1882. Grétry, sa vie et ses oeuvres, Paris : Gauthier-Villars, 1884 (Extrait du T. XXXVI des "Mémoires couronnés et autres Mémoires publiés par l'Académie royale de Belgique", 1884). Jean de Ockeghem, maître de la chapelle des rois Charles VII et Louis XI, étude bio-bibliographique, d'après des documents inédits, Nogent-le-Rotrou : impr. de Daupeley-Gouverneur, 1893 (Extrait des "Mémoires de la Société de l'histoire de Paris et de l'Ile-de-France". T. XX, 1893). Notes sur l'histoire du luth en France, Turin : Bocca, 1899 (Extrait de la "Rivista musicale italiana". T. V. fasc. 4, 1898, et T. VI, fasc. 1, 1899). Les concerts en France sous l'Ancien Régime, Paris : Librairie Fischbacher, 1900. Palestrina, Paris : F. Alcan, 1906. Haydn, Paris : F. Alcan, 1909. Musique et musiciens de la vieille France : les musiciens de Philippe le Hardi ; Ockeghem ; Mauduit ; origines de la musique descriptive, Paris : F. Alcan, 1911. Sébastien de Brossard : prêtre, compositeur, écrivain et bibliophile, 165...-1730 d'après ses papiers inédits, Paris : Société de l'Histoire de Paris et de l'Île-de-France, 1896 (Extrait des "Mémoires de la Société de l'Histoire de Paris et de l'Île-de France", t. XXIII, 1896). Haendel : biographie critique, Paris : H. Laurens, (1913). Dictionnaire pratique et historique de la musique (achevé et publié par Amédée Gastoué), Paris : A. Colin, 1926.

Manuscrits : La correspondance de Marie Bobillier est conservée au Département de la musique de la Bibliothèque nationale de France.