Médecin français d’origine danoise, il commence ses études aux Pays-Bas et les poursuit à Paris, où il se convertit au catholicisme sous l’influence de Jacques Bénigne Bossuet (1627-1704) dont il adopte le prénom. Il devient démonstrateur d’anatomie et de chirurgie au Jardin du roi et il entre à l'Académie royale des sciences où il est élève d'Alexis Littré en 1707, puis de Joseph-Guichard Du Verney en 1715, avant de devenir associé anatomiste en 1716, puis pensionnaire anatomiste en 1722. Au début des années 1740, il dirige la construction d’une nouvelle salle consacrée à la dissection, encore visible rue de la Bûcherie à Paris. En 1743, il commence à enseigner à l’université de Paris. Il a favorisé la formation de Jacques René Tenon. Il collabora avec les anatomistes François-Joseph Hunauld et Joseph Guichard Duverney. L'hiatus de Winslow porte son nom.