Henri Guinier est agrégé de médecine.

Élève de la faculté de Montpellier, chirurgien élève à l'hôpital militaire de Metz et à l'hôpital militaire de perfectionnement du Val-de-Grâce à Paris, élève libre de la Faculté de Paris, puis faculté de Montpellier où il y a terminé ses études. Il est devenu docteur en médecine en 1857 puis a réussi le concours de l'agrégation de médecine avec le rang de premier. En 1865 il est candidat à la chaire de thérapeutique et de matière médicale mais n'est pas reçu.

Il est membre de l'Académie des sciences et lettres de Montpellier, section Médecine, siège XVIII, de 1858 à 1877.