Jean-Baptiste Mahé est un médecin français.
Il avait été successivement professeur de clinique à l'Ecole de médecine navale de Brest, et médecin sanitaire à Constantinople pendant dix ans. Parmi les travaux qu'il a laissés, on peut citer, indépendamment de sa thèse inaugurale qui avait pour titre : De l'application de la méthode expérimentale à la thérapeutique, son mémoire intitulé : Tuberculose et phtisie pulmonaire, son Compte rendu de la clinique médicale de l'hôpital de Brest pendant les années 1867, 1868 et 1869, et son Manuel pratique d'hygiène navale.
Mahé a été un collaborateur actif des Archives de médecine navale.
A l'époque de la Commune, Mahé a réussi, par un acte de sang-froid et de courage, à sauver le ministère de la Marine, menacé d'incendie par les insurgés.
Il est élu correspondant national de l'Académie de médecine pour la division d’anatomie et physiologie le 29 juin 1886.