Pharmacien, André Aubry soutient en 1914 sa thèse de doctorat devant l'École supérieure de pharmacie de Paris, le directeur de thèse étant Émile Bourquelot. Elle porte sur : "Recherches sur la synthèse biochimique de quelques d-glucosides à au moyen de la glucosidase A".
Il est interne des hôpitaux de Paris.